色譜是一種分離分析手段，分離是核心，因此擔負分離作用的色譜柱是色譜系統的心臟。對色譜柱的要求是柱效高、選擇性好，分析速度快等。用于HPLC的各種微粒填料好多孔硅膠以及以硅膠為基質的鍵合相、氧化鋁、有機聚合物微球(包括離子交換樹脂)、多孔碳等，其粒度一般為3，5，7，10um等，柱效理論值可達5～16萬/米。對于一般的分析只需5000塔板數的柱效；對于同系物分析，只要500即可；對于較難的分離物質對則可采用高達2萬的柱子，因此一般10～30cm左右的柱長就能滿足復雜混合物分析的需要。
 

　　液相色譜柱的柱效受柱內外因素影響，為使色譜柱達到較佳效率，除柱外死體積要小外，也要有合理的柱結構(盡可能減少填充床以外的死體積)及裝填技術。即使較好的裝填技術，在柱中心部位和沿管壁部位的填充情況總是不一樣的，靠近管壁的部位比較疏松，易產生溝流，流速較快，影響沖洗劑的流形，使譜帶加寬，這就是管壁效應。這種管壁區大約是從管壁向內算起30倍料徑的厚度。在一般的液相色譜系統中，柱外效應對柱效的影響遠遠大于管壁效應。
 

　　液相色譜柱的規則：
 

　　色譜柱按用途可分為分析型和制備型兩類
 

　　①常規分析柱(常量柱)，內徑2~5mm,柱長10~30cm；
 

　　②窄徑柱(narrowbore)，內徑1~2mm，柱長10~20cm；
 

　　③毛細管柱(又稱微柱microcolumn)，內徑0.2~0.5mm；
 

　　④半制備柱，內徑>5mm；
 

　　⑤實驗室制備柱，內徑20~40mm，柱長10~30cm；
 

　　⑥生產制備柱內徑可達幾十厘米。